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[Pymol] 最新Pymol永久免费使用-Win-Mac-Linux

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发表于 2018-9-18 17:17:30 | 显示全部楼层 |阅读模式

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最新版Pymol2.3下载与安装
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很多人现在发现Pymol新的版本已经下载不到安装版了,

还担心Pymol是商业软件不敢使用!


以下是Pymol官方网站对版权的描述。

Open-Source Philosophy


PyMOL is a commercial product, but we make most of its source code freely available under a permissive license. The open source project is maintained by Schrödinger and ultimately funded by everyone who purchases a PyMOL license.

Open source enables open science.
This was the vision of the original PyMOL author Warren L. DeLano.


从此描述来看,Pymol是一个开源项目,这是其创始人Warren Lyford DeLano先生一直坚持的。

你大可以放心的免费使用源码编译后的Pymol用于学术研究。






接下来我们将分享最新版的Pymol 2.3的安装教程,


该方法支持三大操作系统Windows、Linux、Mac,


这里我们以Windows10操作系统为例。






第一步:下载Anaconda

新手建议选择Python 3.6 Version
如果你电脑中还有需使用Pyhon 2.7的软件,建议选用Python 2.7 Version,后续设置环境变量。
1.png



第二步:安装Anaconda

建议新手在选项页面打钩。
(熟悉环境变量设置的朋友可以不用勾选,安装完后手动设置会更好。)

QQ截图20180918112257.png

安装过程需要较长时间,请耐心等待。


第三步:下载Pymol

从附件中下载最新的Pymol 2.3 pymol-2.3.0a0-cp36-cp36m-win_amd64.whl (7.56 MB, 下载次数: 173, 售价: 10 金币)
发表于 2018-12-1 13:54:26 | 显示全部楼层
非常非常非常感谢 灰太狼 和 猫的仁 提供的强大资源,翻了几个坑,安装上了。给后来人员几个tips:
1. 安装anaconda后,你装的是pythonX的anaconda,你就去 猫的仁 提供的网站找 cpX的whl去下载,然后按照 灰太狼的 步骤去安装
2. 在存在whl的 文件夹 文件夹 文件夹 上shift+右键,不是直接在whl上右键
3. 如果显示有问题,如结构变暗,去set里面找rendering的几个选项一个一个点点试试,总有一个管用。一般是OpenGL的shade造成的。
 楼主| 发表于 2018-9-27 11:04:22 | 显示全部楼层
xufund 发表于 2018-9-27 09:12
请问MAC系统按这个方法安装的话,类似于pymol-2.3.0a0-cp36-cp36m-win_amd64.whl 的文件在哪里下载?
...

当然还有一种方法,就是在mac下安装好了conda(其实就是一个python和计算库环境),然后打开conda的终端,直接编译pymol源文件,一样的。
发表于 2018-12-1 13:42:04 | 显示全部楼层
HPLC 发表于 2018-11-18 11:16
pymol-2.3.0a0-cp36-cp36m-win_amd64.whl is not a supported wheel on this platform.pymol-2.3.0a0-cp36- ...

cp36表示是python3.6平台使用的wheel,去 猫的仁 用户提供的网站https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol,下载cp27的wheel安装
发表于 2018-9-18 21:49:00 | 显示全部楼层
win7怎么安装???
 楼主| 发表于 2018-9-18 22:42:55 | 显示全部楼层

一样的过程,我只是拿win10举个例子。
发表于 2018-9-19 08:52:45 | 显示全部楼层
果然是好东西
 楼主| 发表于 2018-9-19 09:58:23 | 显示全部楼层

安装上了吗?
发表于 2018-9-19 12:09:49 | 显示全部楼层
氢原子与重原子连接的单键的棍棒模型显示得特别细,如何调成和其它键一样粗细?
发表于 2018-9-19 13:28:52 | 显示全部楼层
为何我点了购买没有反应?
发表于 2018-9-19 13:31:37 | 显示全部楼层
求问点了购买附件,然后就没有然后了怎么办
 楼主| 发表于 2018-9-19 13:55:14 | 显示全部楼层
zycz138 发表于 2018-9-19 12:09
氢原子与重原子连接的单键的棍棒模型显示得特别细,如何调成和其它键一样粗细? ...

其实,这样是为了后面的氢键显示好看。如果非要改成一样,请见图。 QQ截图20180919135352.png
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