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[Dock] SeeSAR:最适合初学者使用的分子对接软件

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发表于 2021-10-8 13:44:23 | 显示全部楼层 |阅读模式

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SeeSAR 是一款著名的药物设计软件,用户涵盖拜耳、罗氏、默克等著名的国际制药公司,功能从虚拟筛选到基于片段的设计,覆盖药物发现的每一步,其高效和易于使用的特点使每一个科研工作者可以更轻松的推进研究。

SeeSAR 可以安装在任何平台(Windows、Linux和Mac OS),不需要昂贵的服务器,只需要简单的下载安装,不论你是药物设计的老手,还是刚入门的新手,不论是你正在从事一个项目,还是仅仅有点儿兴趣,我们都欢迎您使用SeeSAR开始您的药物设计。


                               
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SeeSAR的操作主要在各种模式下进行,如蛋白模式中,只需要将目标蛋白文件拖入,或者在搜索框中搜索,蛋白就会自动呈现在窗口;

结合位点模式中,只需要鼠标点击一下,就可以自动检测配体的结合位点,当然,你也可以手动添加单个残基进行精准的扩展;

对接模式中,只需要导入配体文件,鼠标点击一下化合物,就可筛选库中的活性成分,且基于Hyde的亲和力评估,可以让你更加直观的分子配体和靶标的相互作用。


                               
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SeeSAR的操作远不止如此,如在蛋白编辑模式中,你可以直接对蛋白进行编辑,从而引入突变或自定义侧链,探究旋转异构体;

分子编辑模式中,你可以即时的对分子进行修改并使用;

分析模式中,你可以进一步计算ADME性能;

启发模式中,你可以探索新的空腔,而且基于片段的先导发现(FBLD)方法可以在数秒内提供骨架替换、分子生长和片段连接。当然,你还可以探索更多的功能,在对接模式中,你会发现在传统的标准对接中,还有高效的模板对接,而且还具有共价对接,在共价对接基础上,我们还贴心的推出了一系列共价对接文库。

你所需要做的就是,就是下载SeeSAR,将其运用到你的研究中,并加速你的研究。

新时代的药物发现需要更多年轻科研工作者的加入,为此,我们推出长期试用版license以满足更多人的需求,具体规则如下:
只需填写试用版License申请,发送至 tx@fendipharma.com 即可获得两个月的 Biosolveit 旗下软件的全部使用权限,如试用结束,有购买需求用户可咨询ygb@moldesigner.cn

对于广大有分子模拟和药物设计需求的用户,经费紧张仍有科研需求的用户,我们仍鼓励其继续使用,只需申请延长试用期即可。

试用版license 申请书 链接:https://pan.baidu.com/s/1xNQ6iRh0wVI4kTlMJCzaaA
提取码:fend

欢迎有兴趣的用户加入SeeSAR用户群,群无法添加可添加客服微信:SeeSAR_2021
seear.jpg

试用版License.doc

38.5 KB, 下载次数: 8

 楼主| 发表于 2021-10-11 09:48:21 | 显示全部楼层
panacea008 发表于 2021-10-11 09:45
up主给力,请问是试用2个月后就不能使用了吗?

可以继续试用,直到大家完成项目。只是通过试用的方式让真正有需求的用户留下来

点评

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  发表于 2021-10-11 10:13
 楼主| 发表于 2021-10-11 09:53:18 | 显示全部楼层
tuxiao 发表于 2021-10-11 09:45
看你的需求啦,SeeSAR最大的特点就是操作简单流畅,如果你只是筛选下活性化合物,那么SeeSAR可以让你更加 ...

至于你提出的合成问题,这个在高校确实有这个问题,大家都忙着做自己的实验,合成的功底也有很大差别,但这也无法避免,SeeSAR只是提供一个好的平台,让大家可以更加专注于科研本身,而不是被各种操作,软件学习搞的晕头转向
 楼主| 发表于 2021-10-11 09:45:03 | 显示全部楼层
txfight 发表于 2021-10-10 19:21
软件中各种生物位点齐全、规范,便于配置、管理,结构良好,易读、易于理解。药物是设计出来,但是现实怎么 ...

看你的需求啦,SeeSAR最大的特点就是操作简单流畅,如果你只是筛选下活性化合物,那么SeeSAR可以让你更加的专注于靶点选择的本身,而不是软件操作的学习;如果你要是做药物设计,那SeeSAR基于HYde的可视化亲和力,可以让你更加直观的设计分子,更加轻松的进行片段生长,核心替换等等一系列功能
 楼主| 发表于 2021-10-9 10:56:17 | 显示全部楼层
shown_o0v44 发表于 2021-10-9 10:47
我昨天中午已经发邮件了,不知道为什么还没有审核通过,Ծ‸Ծ  Ծ‸Ծ

看一下,是不是到垃圾箱去了,应该都回复了
发表于 2021-10-9 09:12:53 | 显示全部楼层
我遇到了一个操作上的问题,我想在原本配体的位置上进行其他小分子的对接,但是我点那个模板对接的时候,就总是跳出一个选择框救救孩子吧

评分

参与人数 1金币 +10 收起 理由
tuxiao + 10 淡定!

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 楼主| 发表于 2021-10-9 10:39:31 | 显示全部楼层
飞天遁地小阙阙 发表于 2021-10-9 09:12
我遇到了一个操作上的问题,我想在原本配体的位置上进行其他小分子的对接,但是我点那个模板对接的时候,就 ...

不太理解你的话,你可能是点错地方了,模板对接要先选择一个分子作为模板,然后才能进行模板对接,可以再看下邮件里的那个操作文档
发表于 2021-10-9 10:47:39 | 显示全部楼层
我昨天中午已经发邮件了,不知道为什么还没有审核通过,Ծ‸Ծ  Ծ‸Ծ
发表于 2021-10-9 17:27:09 | 显示全部楼层
tuxiao 发表于 2021-10-9 10:56
看一下,是不是到垃圾箱去了,应该都回复了

谢谢,已经看到了
发表于 2021-10-10 19:21:18 | 显示全部楼层
软件中各种生物位点齐全、规范,便于配置、管理,结构良好,易读、易于理解。药物是设计出来,但是现实怎么合成?
发表于 2021-10-10 19:22:50 | 显示全部楼层
tuxiao 发表于 2021-10-9 10:56
看一下,是不是到垃圾箱去了,应该都回复了

发表于 2021-10-11 09:45:10 | 显示全部楼层
up主给力,请问是试用2个月后就不能使用了吗?

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参与人数 1金币 +50 收起 理由
tuxiao + 50 方便以后你在论坛的操作

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