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【分子动力学软件】 今日: 0|主题: 458|排名: 2 

本版主要交流分子动力学软件的安装和使用技巧,如Gromacs、NAMD、Lammps、AMBER等。
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本版置顶 隐藏置顶帖 [NAMD] 关于NAMD这个东东 attach_img digest  ...2 史小史 2016-3-29 122146 Gino 2018-4-24 22:10
本版置顶 隐藏置顶帖 [Gromacs] GROMACS中文使用手册最新版——2015年 attachment digest 川大-灰太狼 2016-1-5 82200 tck061621106 2017-8-21 17:26
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[AMBER] 如何从100ns的dcd 文件里截取force New Lordking 昨天 15:34 015 Lordking 昨天 15:34
[NAMD] 请问如何修改不同原子间的非成键参数? 新人帖 yff 2018-6-16 085 yff 2018-6-16 01:58
[AMBER] 如何查看MDCRD/DCD 里的信息 Lordking 2018-5-18 0201 Lordking 2018-5-18 01:31
[Gromacs] 助Gromacs pbc=xy nwall=2时几个水分子从上面的墙跑出(z轴方向... 新人帖 轻剑飞扬 2018-5-16 0193 轻剑飞扬 2018-5-16 14:12
[其他] 【书籍】分子动力学模拟的理论与实践-陈正隆 - [售价 5 金币] attach_img 川大-灰太狼 2018-5-10 0246 川大-灰太狼 2018-5-10 11:26
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[Gromacs] GROMACS建模 wgmgdt 2017-6-28 2548 2012年9月4日 2018-4-27 13:45
[AMBER] 跑AMBER MD 能得到蛋白质断开,分散的结果吗? Lordking 2018-4-25 1276 川大-灰太狼 2018-4-26 17:29
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[NAMD] 在工作站的namd显示如下错误 ,请大神指教 Gino 2018-4-24 0204 Gino 2018-4-24 22:03
[AMBER] AMBER16 CUDA GPU 计算 error message 新人帖 attach_img Lordking 2018-4-23 0197 Lordking 2018-4-23 08:06
[其他] 膜模拟之后化学键断了 新人帖 attach_img 不会游泳的鱼 2016-11-1 5512 白杨 2018-4-7 23:50
[其他] 【致谢飞天大神及各位坛友】ubuntu、gromacs、g_mmpbsa的安装  ...2 light 2014-11-27 112951 数据挖掘 2018-3-30 09:29
[NAMD] namd出错 DIDN'T FIND vdW PARAMETER lusandan 2016-11-10 1646 lusandan 2018-3-7 10:33
[NAMD] NAMD时出现了报错 lusandan 2016-11-14 3718 lusandan 2018-3-7 10:30
[AMBER] sander.MPI并行运算速度慢 半里格 2017-11-18 6866 viger87 2018-3-2 11:43
[AMBER] 急切希望得到帮助啊啊:计算mmpbsa总是出现com.prmtop出错 新人帖 attach_img  ...2 乐仁释 2016-6-10 191512 yuanlinchen 2018-2-7 21:05
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