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[AMBER] WHAM计算出的PMF如何转换成类似于论文中的PMF

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发表于 2022-3-2 19:45:36 | 显示全部楼层 |阅读模式

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在AMBER的模拟中,把一个小分子拉过通道后,进行了伞形采样,然后用WHAM计算的得到的PMF是上图,但是我想得到类似于下面的图,请问我该怎么办?

                               
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