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【分子动力学软件】 今日: 0|主题: 464|排名: 9 

本版主要交流分子动力学软件的安装和使用技巧,如Gromacs、NAMD、Lammps、AMBER等。
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全局置顶 隐藏置顶帖 招聘PROTAC药物合成、药物设计研究员 川大-灰太狼 2018-10-8 71222 oceansky 2018-11-10 16:03
全局置顶 隐藏置顶帖 欢迎加入BioMS论坛的2000人QQ讨论群 川大-灰太狼 2018-11-2 0639 川大-灰太狼 2018-11-2 09:12
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本版置顶 隐藏置顶帖 [Gromacs] GROMACS中文使用手册最新版——2015年 attachment digest 川大-灰太狼 2016-1-5 82739 tck061621106 2017-8-21 17:26
本版置顶 隐藏置顶帖 [Gromacs] 如何在gromacs中实现有机溶剂体系的模拟 attachment digest  ...2 海洋 2013-12-24 194598 Warlock.Y 2015-5-8 11:42
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[NAMD] namd算结合自由能 qian430 2013-7-17 52189 akydxfz 2019-2-28 13:43
[AMBER] amber16计算MMGBSA出现错误failed with prmtop 新人帖 - [回帖奖励 5 ] xiaoniurj 2019-1-14 0151 xiaoniurj 2019-1-14 10:09
悬赏 [Gromacs] 细胞壁的MD模拟 - [悬赏 1 金币] 白杨 2018-8-4 4690 白杨 2018-12-7 23:57
[Gromacs] not found in residue topology database attach_img 冬雨寒 2018-12-5 1262 白杨 2018-12-7 23:54
[Gromacs] 求大佬指点 新人帖 倔强的芥末 2018-10-15 1301 倔强的芥末 2018-11-20 10:37
[Gromacs] gromacs产生蛋白-RNA的top文件 张钊 2014-10-11 1896 yuyang 2018-11-14 18:01
[Gromacs] 请问一下,如何将Windows系统下的文件拷贝到linux下!!!! 新人帖 look82165 2018-9-28 8865 Xiaoxuan97 2018-10-2 10:14
[AMBER] 用amber中的MMPBSA算二聚体结合能的问题 attach_img - [回帖奖励 10 ] 疯狂的鬼马 2017-9-18 21061 疯狂的鬼马 2018-9-24 21:11
[Gromacs] Gromacs FDA 的使用 Lordking 2018-7-6 0570 Lordking 2018-7-6 10:16
[AMBER] 如何从100ns的dcd 文件里截取force Lordking 2018-6-24 0398 Lordking 2018-6-24 15:34
[NAMD] 请问如何修改不同原子间的非成键参数? 新人帖 yff 2018-6-16 0567 yff 2018-6-16 01:58
[AMBER] 如何查看MDCRD/DCD 里的信息 Lordking 2018-5-18 0688 Lordking 2018-5-18 01:31
[Gromacs] 助Gromacs pbc=xy nwall=2时几个水分子从上面的墙跑出(z轴方向... 新人帖 轻剑飞扬 2018-5-16 0796 轻剑飞扬 2018-5-16 14:12
[其他] 【书籍】分子动力学模拟的理论与实践-陈正隆 - [售价 5 金币] attach_img 川大-灰太狼 2018-5-10 0786 川大-灰太狼 2018-5-10 11:26
[AMBER] 用AMBER 优化LOOP的系数设置 attach_img Lordking 2018-5-3 0477 Lordking 2018-5-3 23:24
[Gromacs] GROMACS建模 wgmgdt 2017-6-28 1908 2012年9月4日 2018-4-27 13:45
[AMBER] 跑AMBER MD 能得到蛋白质断开,分散的结果吗? Lordking 2018-4-25 1680 川大-灰太狼 2018-4-26 17:29
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