生物分子模拟论坛»论坛 › -≡ 生物分子模拟软件区 ≡-› 【分子动力学软件】

【分子动力学软件】今日: 0|主题: 468|排名: 8

本版主要交流分子动力学软件的安装和使用技巧，如Gromacs、NAMD、Lammps、AMBER等。

新窗全部主题最新热门热帖精华更多 \| 显示置顶		作者	回复/查看	最后发表

隐藏置顶帖免费下载科研文献方法：Sci-Hub（2018.8.22更新） ...2	川大-灰太狼 2015-6-30	19168062	zhouxj 2022-4-12 10:02
隐藏置顶帖欢迎加入BioMS论坛的2000人QQ讨论群	川大-灰太狼 2018-11-2	052071	川大-灰太狼 2018-11-2 09:12
隐藏置顶帖 [Gromacs] GROMACS中文使用手册最新版——2015年 ...2	川大-灰太狼 2016-1-5	1431809	luarence 2020-9-1 19:26
隐藏置顶帖 [NAMD] 关于NAMD这个东东 ...2	史小史 2016-3-29	1233980	Gino 2018-4-24 22:10
隐藏置顶帖 [Gromacs] 如何在gromacs中实现有机溶剂体系的模拟 ...2	海洋 2013-12-24	1937308	Warlock.Y 2015-5-8 11:42
版块主题
[其他] 计算RMSF - [悬赏 20 金币]	半里格 2017-12-25	224351	xhj 2022-10-5 17:41
[AMBER] WHAM计算出的PMF如何转换成类似于论文中的PMF	xlllg 2022-3-2	08175	xlllg 2022-3-2 19:45
[AMBER] Amber金属蛋白动力学模拟教程	川大-灰太狼 2013-8-26	920797	Dockerr 2021-10-29 17:09
[Gromacs] [GROMACS]关于添加小分子力场后报错问题	吴雨龙_lQb2l 2021-10-12	013084	吴雨龙_lQb2l 2021-10-12 19:51
[AMBER] 原创--金属酶体系的分子动力学模拟 ...2	Babyblue 2013-3-11	1642824	Rose520 2021-6-19 15:34
[AMBER] 关于AMBER动力学蛋白质准备过程中Histidine 的质子化预测及... ...2	墨竹晓风 2013-1-2	1937644	Kamala 2021-6-4 09:58
[Gromacs] GROMACS计算MMPBSA ...2 3	eming 2014-1-15	3350526	Laide 2020-12-1 21:42
[Gromacs] 请问为什么创建的十二面体水盒子中体系不在盒子中央	kulougui 2020-9-9	08648	kulougui 2020-9-9 18:50
[Gromacs] Automated topology builder(ATB)提交任务问题	琦锅锅_XI7es 2020-9-7	07561	琦锅锅_XI7es 2020-9-7 17:09
[Gromacs] 运行Gromacs的pdb2mgx时提示氨基酸的原子不完整	背包旅客 2015-5-8	19368	琦锅锅_XI7es 2020-9-5 10:21
[Gromacs] 用amber ff14SB力场中的126lj非键模型进行金属蛋白模拟	stone 2015-10-27	612224	苏幕_VQFGr 2020-9-3 15:14
[AMBER] 用MM-PBSA方法怎么计算单残基的结合能贡献值啊？	背包旅客 2015-11-6	110473	Gina_jYn3L 2020-8-18 16:36
[NAMD] 使用MolAICal基于NAMD模拟结果计算小分子和蛋白MM/GBSA的教程	MolAICal 2020-8-16	07383	MolAICal 2020-8-16 19:58
[Gromacs] 轨迹的周期边界性问题	shadow 2020-7-20	18765	川大-灰太狼 2020-7-27 09:43
[Gromacs] Gromacs配体问题	旭日希望 2013-10-25	410325	wx_HeEE9U9E 2020-7-12 20:32
[其他] 【书籍】分子动力学模拟的理论与实践-陈正隆 - [售价 5 金币]	川大-灰太狼 2018-5-10	110201	娜娜 2020-7-6 12:12
[Gromacs] 金属蛋白	五支折断的箭 2020-5-2	012022	五支折断的箭 2020-5-2 18:28