Discovery Studio同源模建、分子动力学、分子对接和药效团教程

川大-灰太狼 · 发表于 2012-11-21 08:58:43

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此教程为创腾09年暑期培训班教程，包含同源模建、分子动力学、分子对接、药效团和ADMET预测。

川大-灰太狼 · 发表于 2018-9-4 19:29:17

Lovecheng 发表于 2018-9-3 18:16
亲，我请教一些问题，最近在学习分子对接，我们的蛋白未知，采用同源模建建好模板，下一步的模板优化和分子 ...

商业分子对接软件LeadIT中的FlexX，GOLD，Glide都不错，免费的可以使用autodock。
模板优化，这个主要根据你的具体需求来定，如果模板已经有90%以上的序列一致性了，可以不用优化。
后期，用分子动力学跑跑看，能否稳定和平衡。

川大-灰太狼 · 发表于 2015-6-14 23:27:55

有效提取发表于 2015-6-14 10:32
谢谢楼主分享！ DS 打分是不是比autodock 更能使人信服些呐？准备下决心自学了 ...

大家普遍认为DS的分子对接比较鸡肋，不是很好，有些情况还不如Autodock。商业对接软件用得较多且准确率高的是FlexX(leadIT中的对接模块)，Glide（Schordinger中的对接模块），Gold等。

哎呀咿呀 · 发表于 2019-7-3 10:17:22

川大-灰太狼发表于 2018-9-4 19:29
商业分子对接软件LeadIT中的FlexX，GOLD，Glide都不错，免费的可以使用autodock。
模板优化，这个主要根 ...

请问有autodock安装包吗，官网打不开

冰晶石 · 发表于 2012-11-21 10:03:09

谢谢分享{:soso_e163:}

zdan2012 · 发表于 2012-12-26 15:29:04

谢谢，如果资源介绍还能够稍微详细一点点就好了。。。

loki · 发表于 2013-1-18 08:54:12

请问购买之后在哪下载啊

川大-灰太狼 · 发表于 2013-1-18 09:04:16

直接点击就可以了哈！pdf格式的

lovingma · 发表于 2013-1-18 10:19:00

谢谢！！

永在追赶 · 发表于 2013-2-7 12:28:54

谢谢您的分享呀

付玲 · 发表于 2013-3-17 00:28:52

谢谢！正好需要！

l732114684 · 发表于 2013-3-17 09:41:25

thank you for sharing!

NK十一 · 发表于 2013-3-29 21:40:43

你好！我在用DS做同源模建的时候，做到align sequences to templates这步时，error,NCBI BLAST Failed,请问是怎么回事呀？

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