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[提问] ambertools1.5中用acpype得不到结果的问题

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发表于 2014-1-4 20:34:37 | 显示全部楼层 |阅读模式

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安装了anmbertools1.5和acpype
用acpype做小分子力场参数时,一直没有等到计算结果,几番查找原因
发现ambertools中的sqm不正常。显示如下:

[root@localhost src]# which sqm
/opt/amber11/AmberTools/bin/sqm
[root@localhost src]# sqm

  Unit    5 Error on OPEN: mdin                                                                                                                                                                                                                                                            

  Unit    5 Error on OPEN: mdin   


请各位大大给予帮助,不胜感激!

发表于 2014-1-8 08:57:54 | 显示全部楼层
你的环境变量里面设置了 sqm 文件的路径了吗?
可以把你的环境变量设置发上来看看。
发表于 2014-1-8 09:25:39 | 显示全部楼层
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