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[提问] 关于vina的conf.txt文件问题

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发表于 2013-12-24 20:05:40 | 显示全部楼层 |阅读模式

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又有问题问大家了  我在论坛上看到了babyblue 有关conf.txt的编写
[code=Bash width=600px]config.cgf
#######################################################
receptor = rec.pdbqt //受体的名称
center_x = -2
center_y = 0            //盒子的质心
center_z = -4
size_x = 30
size_y = 32            //盒子的大小
size_z = 46
exhaustiveness = 20       //计算的复杂度
cpu = 16                       //并行计算
energy_range = 4          //作用能间距等级,这个我到现在也没搞懂
num_modes = 20           //保留构想数目,这个是cluster之后的结果,实际构想可能很多
#######################################################[/code]
我不是很懂  我的conf.txt文件中,没有
exhaustiveness =     
cpu =                       
energy_range =
就出现了警告 Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all CPUs  
想问一下我的conf.txt缺少的那三项如果没写默认值是多少呢?  帮帮忙哦!


我的conf.txt中,原来缺少
exhaustiveness=
cpu=
energy_range=
缺少这三项  所以出现了警告Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all CPUs
所以想请教一下 我的conf.txt中缺少的这三项参数  如果没有写默认值是多少呀!  帮帮忙哦!
发表于 2013-12-24 20:31:43 | 显示全部楼层
分别是8 , cpu会自动检测的,如果失败的话就是1, 最后一项就是3
 楼主| 发表于 2013-12-24 20:51:43 | 显示全部楼层
发表于 2013-12-25 10:38:21 | 显示全部楼层
就出现了警告 Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all CPUs  。。这个警告没有关系。只是告诉你“你的cpu允许设置更高的exhaustiveness”
 楼主| 发表于 2013-12-26 10:50:34 | 显示全部楼层
墨竹晓风 发表于 2013-12-25 10:38
就出现了警告 Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all C ...

谢谢您的帮助!
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