Pymol 使用小技巧5-计算和标示键角、二面角等

苏祖清 · 发表于 2013-9-4 16:00:03

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Pymol 使用小技巧5-计算与标示键角、二面角等
其实Pymol还有计算和标示出键角、二面角等的功能。使用方法很简单！

第一步，点击菜单栏上面的wizard 里面 measurement。

第二步，在右边蓝色的 measurement mode 中选择 Angles（点击distance，会出现不同的模式的选择，选择angles就是键角，选择dihedral就是二面角，还有其他一些选项）。
QQ图片20130904155642.jpg

第三步，依次点你的分子上的原子，三个原子出来键角（如果是二面角则是点击四个原子），效果如下图。

苏祖清 · 发表于 2013-9-5 09:02:27

谢谢灰哥，帮我修改我的帖子。全力支持生物模拟论坛

川大-灰太狼 · 发表于 2013-9-5 14:24:31

苏祖清发表于 2013-9-5 09:02

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谢谢灰哥，帮我修改我的帖子。全力支持生物模拟论坛

不客气哈，是pymol太强大了！

C15056981927 · 发表于 2015-3-18 23:42:23

你好，最近正纳闷二面角不能用呢，我怎么点击四个原子后，没有二面角结果出来呢，能不能麻烦大大神详细点，谢谢!

hardbeaver · 发表于 2016-5-8 21:25:31

谢谢楼主分享经验。

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