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对接基础问题汇总

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发表于 2017-6-3 10:21:35 | 显示全部楼层
金属酶怎么对接?可以在蛋白PDB文件中改动吗
发表于 2017-6-3 10:26:28 | 显示全部楼层
我的酶PDB结构里含有两个金属离子,其中有铬离子,然后我按照教程去做的时候说要添加铬离子的参数,能帮忙解答一下吗 我还看到论坛有关于金属酶的对接 操作了下没成功
发表于 2017-11-21 13:46:17 | 显示全部楼层
杨梓煜 发表于 2017-1-4 17:29
您好,老师让我做分子对接,我们这没人做个,我想知道我首先需要下载哪几个软件啊?用autodock对接。万分感 ...

哪个学校?
发表于 2018-9-5 21:13:26 | 显示全部楼层
shouzhangxin 发表于 2015-1-20 15:08
你好,请教一下在配体 pdb文件产生pdbqt文件时 配体中出现化学键断裂的问题是什么原因?配体pdb文件是从gau ...

你可以试试先做一个能量优化,再导入。比如MM+这类的
发表于 2018-10-3 07:48:23 | 显示全部楼层
学习了。谢谢!
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