【阿里原创教程1】巧用chimera1.7修复PDB缺失结构

solo7773 · 发表于 2013-11-21 15:57:00

深表感谢

大工-阿里巴巴 · 发表于 2013-11-21 15:57:09

已解决~在文件保存的时候保存成一个pdb文件，之后再进行叠合就好了~~

谢谢sunshine小朋友。。。

小猪海阔天空 · 发表于 2013-11-21 16:19:49

感谢分享

zilvbu · 发表于 2013-12-17 20:16:09

又来学习了，感谢分享～

达夫 · 发表于 2013-12-19 11:15:20

谢谢分享，赞一个

Charleshen · 发表于 2014-2-6 22:46:42

不错不过有没有文献参考一下呢？

大工-阿里巴巴 · 发表于 2014-3-11 15:08:58

不错不过有没有文献参考一下呢？

实际上loop的修补就是利用了modeller，chimera只是个GUI而已了~哈哈~

Charleshen · 发表于 2014-3-26 16:09:47

实际上loop的修补就是利用了modeller，chimera只是个GUI而已了~哈哈~

好吧我loop氨基酸缺失24个，会不会不准确？？？

璐璐 · 发表于 2014-3-30 09:13:00

先看看教程，modeller解决这类问题的时候有没有特别的参数需要设置啊

大工-阿里巴巴 · 发表于 2014-3-30 09:13:26

好吧我loop氨基酸缺失24个，会不会不准确？？？

24个太长了。。。。必须不准确~哈哈，你看看关于利用rosetta做模建时的loop构建办法http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23744289

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