对接找不到protein.maps.fld

mslrk13518530

   小弟在用ADT进行run dock的时候，设置对接100次，跳出的界面一下子就过去了，不像有的教程说的要一两个小时，在cmd界面输入autodock -p docking.dpf -l docking.dlg ，cmd回馈的反应是
aotudock4: I'm sorry ; I can't find or open ''protein.maps.fld"
autodock4:fatal error : autodock4:I'm sorry;I can't find or open "protein.maps.fld"
autodock4:unsuccessful completion

想请问下在哪一步会生成maps.fld，或者是我在哪一步没有设置好？

川大-灰太狼

mslrk13518530 发表于 2016-4-6 22:05
是的，map文件是在哪生成的？我电脑版本是win8,autodock和adt都是下载最近版的，然后直接在桌面生成的快 ...

我觉得你应该先看看我们编译的autodock教程后，再着手来做。
1、autodock-Win版2014年最新中文版教程
http://bioms.org/forum.php?mod=v ... &extra=page%3D1

2、AutoDock 4.2 中文版 教程 （Bioms小组翻译）
http://bioms.org/forum.php?mod=v ... &extra=page%3D1

mslrk13518530

川大-灰太狼 发表于 2016-4-6 21:31
map文件是在执行autogrid的时候生成的，你可以具体的描述下你的操作过程，然后上传一下你的文件夹。我可以 ...

额，狼哥不好意思，我不懂怎么上传文件夹，我只能把存在在文件夹里的内容打出来。
autodock4.exe
autogird4.exe
dock.glg
dock.gpf
docking.dlg
docking.dpf
ligand.pdbqt
protein.pdb
protein.pdbqt

mslrk13518530

川大-灰太狼 发表于 2016-4-6 22:28
不客气：）那个的确没有了，我明天再重新上传，呵呵。先看看教程，再来做就容易了。远程这样说不好弄清楚 ...

谢谢狼哥，找到原因了，是因为没有edit gpf里面的文件夹路径，十分感谢狼哥！！

川大-灰太狼

这个是因为没有把准备的文件和autogrid ， autodock程序文件放在一个文件夹。

mslrk13518530

灰太狼哥好，我之前就已经把在adt中所生成的文件都放在了同一个文件夹下，或者说要默认文件夹还是哪里？我是放在e盘自己创建的一个文件夹，没有中文目录和符号，（E:\dock）

川大-灰太狼

mslrk13518530 发表于 2016-4-6 11:47
灰太狼哥好，我之前就已经把在adt中所生成的文件都放在了同一个文件夹下，或者说要默认文件夹还是哪里？我 ...

要把 执行文件 也放到这个文件夹中。

mslrk13518530

川大-灰太狼 发表于 2016-4-6 21:26
要把 执行文件 也放到这个文件夹中。

执行文件是指autodock4和autogrid4吗？我也有放在这里面

川大-灰太狼

map文件是在执行autogrid的时候生成的，你可以具体的描述下你的操作过程，然后上传一下你的文件夹。我可以帮你看看。

川大-灰太狼

mslrk13518530 发表于 2016-4-6 21:50
额，狼哥不好意思，我不懂怎么上传文件夹，我只能把存在在文件夹里的内容打出来。
autodock4.exe
autogir ...

你这里面就没有产生map文件，对吧。

mslrk13518530

川大-灰太狼 发表于 2016-4-6 21:56
你这里面就没有产生map文件，对吧。

是的，map文件是在哪生成的？我电脑版本是win8,autodock和adt都是下载最近版的，然后直接在桌面生成的快捷adt运行adt开始进行对接。