GOLD软件疑难解答【版主专贴】

药化神龙

墨竹晓风 发表于 2015-4-27 14:18
欢迎新版主！ GOLD是我的心头好！

谢谢管理员的支持，我会努力学习，服务好大家

栀子花开

版主，我用的是GOLD5.2.2，对接结果显示不出来，点View Solution空白，请问是怎么回事？

laoman

栀子花开 发表于 2015-8-6 09:43
版主，我用的是GOLD5.2.2，对接结果显示不出来，点View Solution空白，请问是怎么回事？ ...

对接完应该先检查gold.err文件，看有没有fatal error，主要是根据这个文件来修改gold.conf文件。gold.log可以看到对接用了多长时间。

栀子花开

laoman 发表于 2015-8-6 14:07
对接完应该先检查gold.err文件，看有没有fatal error，主要是根据这个文件来修改gold.conf文件。gold.log ...

您好，我看了gold.err文件，是空白，请问我哪里做错了？

laoman

栀子花开 发表于 2015-8-14 17:23
您好，我看了gold.err文件，是空白，请问我哪里做错了？

空白就说明对接过程没有错吧，但5.2.2貌似没有View Solution这个按钮啊？楼主能否截个图看看是哪儿点击的？
如果对接没错，那么应该是在File菜单下点击load GOLD results， 弹出对话框，打开对接目录下的gold.conf(或者其他conf，如果名字被改了的话），然后就可以看结果了。

栀子花开

laoman 发表于 2015-8-14 22:30
空白就说明对接过程没有错吧，但5.2.2貌似没有View Solution这个按钮啊？楼主能否截个图看看是哪儿点击的 ...

可是gold.conf文件只有一个小配体（对接蛋白中含有的那个），显示不出所有的。

栀子花开

laoman 发表于 2015-8-14 22:30
空白就说明对接过程没有错吧，但5.2.2貌似没有View Solution这个按钮啊？楼主能否截个图看看是哪儿点击的 ...

截了图但不知道怎么发过去？

药化神龙

栀子花开 发表于 2015-8-18 14:28
截了图但不知道怎么发过去？

你没有把其它的勾选上吧，一般都有啊

另外，可能你对接的有问题

你可以试试用pmol软件打开对接结果呀

laoman

栀子花开 发表于 2015-8-18 14:21
可是gold.conf文件只有一个小配体（对接蛋白中含有的那个），显示不出所有的。 ...

楼主可以把你的gold.conf文件的文本贴出来，大家一看就明白了

栀子花开

药化神龙 发表于 2015-8-18 21:22
你没有把其它的勾选上吧，一般都有啊

另外，可能你对接的有问题

对接没有问题吧，除了没有结果文件，list和Mol2文件都是对的。