gromacs拉伸出现错误

开心果

gchen001 发表于 2014-6-3 23:52

                               
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可能是体系不大适合用PME法算静电相互作用，可以换个方法算静电力试试 shift之类的；或者用1个节点跑会儿， ...

您好 在吗 想问下您做拉伸时是怎样设定拉伸方向的呢  我使用俩点的坐标之差确定方向的 但是我不知道用哪个模拟文件中的坐标  是npt.gro 还是solv_ions .gro文件中的   如果您懂能指导我下吗 有点急 谢谢哦