药物设计中，你考虑过氰基基团吗？

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在药物设计中，你是否考虑在化合物结构中合理引入氰基基团？该基团是否会具有什么特别的生物学功能呢？带着这个问题，查阅了相关文献获得了一篇题目为《Nitrile containing pharmaceuticals: efficacious roles of the nitrile pharmacophore》的综述。

文章总结了不同种类氰基的药物或者是临床上的候选分子与不同靶点之间的相互作用等，如芳香腈，alpha-芳基腈，烯基腈（该结构类型难合成），N-氰基胍，alpha-氨基腈等。

文章依据上述结构给出了氰基的可能生物学功能如下：

1.      羰基的生物电子等排体。

2.      在溶剂化作用下，可以像羟基或者羰基一样作为氢键受体。

3.      氰基作为强的吸电子基团可以和受体中的氨基酸残基或者是金属离子之间形成偶极相互作用。

4.      Azomethine-H2O的生物电子等排体。

5.      羰基过渡态类似物。

6.      卤素的生物电子等排体。

7.      能够改善ADME-Tox等性质。

另外，文章中提到一点在这里指出，供大家参考。即：

也就是脂肪族腈类化合物的alpha位置的氢可能会在肝脏中被氧化成氰醇，其降解后会产生毒性的氰化物。此点在药物设计中尽量避免较好。

上述概括内容供感兴趣的盆友们参考，详情见附件，如有错误之处请批评指正，谢谢O(∩_∩)O！

川大-灰太狼

好文章！好导读 呵呵，感谢你的分享！

北京-构效

很好的文献，偶像威武，先保存下来了

中科院-石头

早之前浏览过这篇好文章，正好现在再认真阅读下。-CN基作为氢键受体很经典的一个例子是喹唑啉类激酶抑制剂中，将3-位N原子替换-CN基取代的C时，使得原本水介导的氢键被-CN基所替代，活性维持。另外，如果，对卤素，尤其是Cl原子被CN基等排体替换的信息，想了解更多，推荐Med. Chem. Commun., 2010,1, 309-318这篇文章。

川大-灰太狼

恩，氰基多用于连接在芳环或者脂肪环上，这样的设计一般都无毒副作用产生。可以替代一些基团或者实现替代间接水分子形成的氢键！