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[AutoDock&Vina] 求Lamarckian Genetic Algorithm(LGA)的资料

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发表于 2013-12-1 10:11:57 | 显示全部楼层 |阅读模式

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小弟发现实验结果与模拟结果有差距,活性好的配体结合能反而较高,小弟以为这可能与对接时Lamarckian Genetic Algorithm的参数设置有关,小弟对参数设置中Population Size,Maximum Number of evals,Maximum Number of generation,Maximum Number of top individuals that automatically survive,等一点都不能理解更别谈自己去设置这些值了。小弟只是想让打分更加合理,希望各位前辈支支招,或者给小弟一些关于LGA和打分函数的链接,小弟在这里先谢谢了!
发表于 2013-12-1 13:55:36 | 显示全部楼层
aotudock 看看论坛里面的说明书
 楼主| 发表于 2013-12-1 20:25:33 | 显示全部楼层
是哪个说明,论坛里autodock的说明太多了!或者晓风哥能否发给我一份?我的邮箱791758753@qq.com
发表于 2013-12-2 09:19:44 | 显示全部楼层

就是这个贴。http://bioms.org/thread-195-1-1.html
另外,你要用回复功能,我才能收到提醒,要不是就不知道你回复了我哟
 楼主| 发表于 2013-12-2 09:42:00 | 显示全部楼层
墨竹晓风 发表于 2013-12-2 09:19
就是这个贴。http://bioms.org/thread-195-1-1.html。
另外,你要用回复功能,我才能收到提醒,要不是就 ...

恩谢谢晓风哥!小弟一定认真去读!
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