ROC曲线的绘制

魂归绝情剑

水晶紫 发表于 2013-11-20 14:35

                               
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所谓decoy的意思不是和活性化合物结构类似，但是没有活性的吗？的活性化合物是1，decoy是0. ...

恩，是的，但是模型不好的话肯定会筛出假阳性嘛，那这个假阳性是设0还是1呢

魂归绝情剑

水晶紫 发表于 2013-11-20 14:35

                               
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所谓decoy的意思不是和活性化合物结构类似，但是没有活性的吗？的活性化合物是1，decoy是0. ...

恩，是的，但是模型不好的话肯定会筛出假阳性嘛，那这个假阳性是设0还是1呢

水晶紫

魂归绝情剑 发表于 2013-11-20 22:14

                               
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恩，是的，但是模型不好的话肯定会筛出假阳性嘛，那这个假阳性是设0还是1呢 ...

做ROC曲线是为了进行模型评价的吧，假阳性它本身是没有活性的或者是decoy是应该标注为0的。正是由于其打分高，模型才会认为它是活性化合物，但是它本身是没有活性的啊。

魂归绝情剑

水晶紫 发表于 2013-11-21 01:31

                               
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做ROC曲线是为了进行模型评价的吧，假阳性它本身是没有活性的或者是decoy是应该标注为0的。正是由于其打 ...

恩恩，是的，就是没有活性的打分却很高而 出现的，当然与此同时也有部分有活性的由于打分低而没被筛出，我想问的就是这种假阳性设为1还是0？

水晶紫

魂归绝情剑 发表于 2013-11-21 08:53

                               
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恩恩，是的，就是没有活性的打分却很高而 出现的，当然与此同时也有部分有活性的由于打分低而没被筛出， ...

假阳性是0啊孩纸，它不是阳性分子（活性分子）。

魂归绝情剑

水晶紫 发表于 2013-11-21 15:54

                               
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假阳性是0啊孩纸，它不是阳性分子（活性分子）。

大人，谢谢啊

魂归绝情剑

水晶紫 发表于 2013-11-21 15:54

                               
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假阳性是0啊孩纸，它不是阳性分子（活性分子）。

大人，谢谢啊{:soso_e128:}

水晶紫

魂归绝情剑 发表于 2013-11-21 19:02

                               
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大人，谢谢啊

不客气，回头做药效团的时候估计还要请教你呢~~~

魂归绝情剑

水晶紫 发表于 2013-11-21 22:07

                               
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不客气，回头做药效团的时候估计还要请教你呢~~~

不敢当，有什么我能解决的肯定帮你解答

开心果

你好 我现在也要做ROC曲线 我不做药效团 知识用autodock和vina做了一下酶抑制剂的虚拟筛选 现在想要比较一下autodock和vina哪个软件更可信对于我所做的筛选来说   需要做一个ROC曲线  但我不知道准备些什么 现在我把对接结果的能量值都提取了出来   是不是还需要将这些能量值按大小顺序排好呀   是不是还要设定cutoff值呀（我不太懂） 如果需要设置cutoff值  那怎样设置呢