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[AMBER] 使用antechamber处理环糊精的一个问题

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发表于 2013-10-29 20:31:53 | 显示全部楼层 |阅读模式

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各位大侠,我自用antechamber产生mol2文件时,命令为:antechamber -i CD.gout -fi gout -o CD.mol2 -fo mol2 -c resp,可出现如下画面:

Info: the number of the path atoms exceeds MAXPATHATOMNUM(10000) for atom[122],extend the size and reallocate the memory automatically
Info: the number of the path atoms exceeds MAXPATHATOMNUM(10000) for atom[123],extend the size and reallocate the memory automatically
Info: the number of the path atoms exceeds MAXPATHATOMNUM(10000) for atom[124],extend the size and reallocate the memory automatically
Info: the number of the path atoms exceeds MAXPATHATOMNUM(10000) for atom[125],extend the size and reallocate the memory automatically


  Unit   10 Error on OPEN: ANTECHAMBER.ESP
这是什么意思?



发表于 2013-10-29 20:39:00 | 显示全部楼层
原子太多,超过了10000个。
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