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[AMBER] 用amber批处理小分子

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发表于 2013-8-8 14:51:00 | 显示全部楼层 |阅读模式

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我想用amber批处理一些小分子得到相应的原子信息,但是在tleap里边不知道怎么来做循环,有没有做过的求指导!
发表于 2013-8-8 18:48:04 | 显示全部楼层
可以采用同一个tleap的input文件,每个小分子采用temp过渡
 楼主| 发表于 2013-8-12 10:35:43 | 显示全部楼层
发表于 2013-8-23 10:06:02 | 显示全部楼层
mshappy 发表于 2013-8-12 10:35
谢谢!问题已经解决!

你好!!我是amber新手,请问怎么解决的??temp怎么过度???
发表于 2013-8-26 17:00:46 | 显示全部楼层
就是说,你每当你处理一个分子的时候,你都命名为temp,处理后,改名为原来的名字
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