生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 773|回复: 3

[AMBER] 求助,如何将amber16的mdcrd转换成VMD识别的格式,谢谢

[复制链接]
发表于 2017-12-11 17:20:11 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
如何将amber16的mdcrd转换成VMD识别的格式,谢谢
发表于 2017-12-26 11:44:47 | 显示全部楼层
直接可以识别啊,载入的时候把文件类型选为amber coordinates with periodic box就可以了
发表于 2017-12-21 21:01:53 | 显示全部楼层
amber16默认的轨迹格式就是vmd能支持的netcdf格式,只要把轨迹的mdcrd后缀改成nc就好了。vmd载入轨迹的时候是这样的:vmd topol.pdb md.nc
发表于 2017-12-12 14:52:43 | 显示全部楼层
cpptraj 读进去再读出来就可以了
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3

GMT+8, 2018-9-26 19:42 , Processed in 0.164459 second(s), 26 queries .

Powered by Discuz! X3.3

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表