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[提问] 有个小问题。希望大神不吝赐教

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发表于 6 天前 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本人第一次在校里的计算服务集群上提交任务,计算gaussian。我在自己的windows电脑上用gaussview画了一个分子,并且生成了gif文件,然后在集群上利用LFS作业调度系统提交作业,但是最后显示:ntrex1: Bad file descriptor。很奇怪,什么叫错误的文件描述?该怎么改正?最后贴上我的提交作业的脚本。
  1. #!/bin/sh

  2. #BSUB -q fat
  3. #BSUB -n 14
  4. #BSUB -R "span[hosts=1]"
  5. #BSUB -cwd .
  6. #BSUB -e %1.err
  7. #BSUB -o %1.out

  8. JOBNAME=`basename "$1" .com`






  9. export g09root=/gpfs/soft/g09/g09D

  10. export GAUSS_SCRDIR=/gpfs/users_home/hy608/ils     #这里要自己设定一个tmp文件
  11. export GAUSS_EXEDIR=/gpfs/soft/g09/g09D
  12. export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/gpfs/soft/g09/g09D

  13. hash -r


  14. cd  /gpfs/users_home/hy608/gaussian/ils        #gjf文件所在的路径
  15. /gpfs/soft/g09/g09D/g09  < 1.gjf > 1.log
复制代码

发表于 4 天前 | 显示全部楼层
你可以构建一个小分子在你电脑上试试,如果如果可以再放到服务器上。确定一下是输入文件有问题还是提交的排队命令有问题
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