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[Gromacs] gromacs95 53a6力场问题

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发表于 2012-12-25 16:01:18 | 显示全部楼层 |阅读模式

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大家做膜蛋白有没有用过gromacs96 53a6 力场吗?我怎么用这个力场跑着,酪氨酸的羟基与苯环不在一个平面上 而且色氨酸上的苯环也不是一个平面结构,不知道大家遇到过这种问题没?{:soso_e100:},准备换个力场用amber99SB或OPLS-AA/L all-atom force field ,但不知道膜的力场参数怎么写?
 楼主| 发表于 2013-1-4 14:23:42 | 显示全部楼层
这个问题解决了哦!
发表于 2013-1-4 16:21:27 | 显示全部楼层
发表于 2013-1-5 09:36:10 | 显示全部楼层
支持分享。。另外AMBER的力场试试amber12SB
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