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楼主: 时光检索

[AutoDock&Vina] 请问这个情况怎么解决,是什么问题,谢谢啦

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 楼主| 发表于 2016-8-9 20:40:43 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2016-8-5 09:51
判断正确与否,这个需要实践的经验。如果从理论上来说,就是要理解分子间的常见相互作用力!哪些是常见的 ...

autodock中,受体中有金属离子,请问参数怎么设置阿,我的有四个zn离子,或是有没有相关的介绍,谢谢啦!
发表于 2016-8-11 22:47:29 | 显示全部楼层
时光检索 发表于 2016-8-9 20:40
autodock中,受体中有金属离子,请问参数怎么设置阿,我的有四个zn离子,或是有没有相关的介绍,谢谢啦! ...

首先看这个金属离子是否在活性位点,与你要对接的小分子是否有作用,如果没有,直接删除。如果有,则可以保留zn,进行对接,autodock默认的原子立场是支持ZN的。
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