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[Gromacs] GROMACS模拟

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发表于 2016-7-1 19:20:13 | 显示全部楼层 |阅读模式

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我用gromacs进行系统模拟,除了蛋白大分子,还有一个FAD辅因子,一个配体。在使用grompp添加离子这一步出错了,我检查了topol.top文件中顺序,并没有问题。现在不知道如何更改了,望各位指点一下,谢谢~
捕获.PNG
发表于 2016-7-7 10:16:21 | 显示全部楼层
目测itp和拓扑不一致,你截的图看不全。
发表于 2016-7-7 10:17:29 | 显示全部楼层
经常会因为编号顺序  少了空格之类的报错,查错要非常之细心。
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