请问，gromacs生成的xtc轨迹怎么转换成amber格式的mdcrd轨迹？

背包旅客 · 发表于 2016-5-27 10:38:54

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本人使用gromacs4.5.5版本做的动力学模拟，得到的是xtc轨迹，可是，我想用amber里面的MMPBSA方法分析单残基能量分解，就必须要将xtc轨迹转换成amber可用的mdcrd轨迹！可是，我一直都不知道能通过什么方式转换格式！！！

尝试过用mdtraj，但是这个是只能读取xtc轨迹和mdcrd轨迹，却没办法将xtc轨迹转换成mdcrd格式的轨迹啊！！！还看到说用yasara软件，我们没有版权，而且发现yasara软件转换amber的mdcrd格式其实也是调用mdtraj软件的mdconverts工具啊！一样无法转换！！！

各位有经验的老师们或者童鞋们，请求你们过来赐教一下！急急急。。。不胜感激~~~跪谢跪谢！！！

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[Gromacs] 请问，gromacs生成的xtc轨迹怎么转换成amber格式的mdcrd轨迹？