有人用过PRODRG吗？

tjpugu · 发表于 2016-4-26 10:08:11

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在用PRODRG将PDB文件转化为GROMACS用的拓扑文件时，为什么总会少三个氢原子，我不太懂他转化的机理，请问这是问什么，PRODRG会去除特定几种H原子吗？

wangpengfei · 发表于 2016-6-26 16:13:49

你是只选择了显示极性和苯环氢吧

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