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[提问] 请问一下gmx distance怎么计算一个蛋白中residue 1和2之间CA的距离?

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发表于 2016-4-1 09:17:12 | 显示全部楼层 |阅读模式

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请问一下gmx distance怎么计算一个蛋白中residue 1和2之间CA的距离?
发表于 2018-1-30 10:53:11 | 显示全部楼层
用make_ndx建一个ndx文件定义两个组,分别包含两个氨基酸的CA原子,然后在gmx distance后面加上 -n xxx.ndx
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