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[AMBER] Amber自带的聚类算法

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发表于 2016-3-22 19:18:10 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 lily_fj 于 2016-3-22 19:21 编辑

新人要准备使用Amber,Amber自带的聚类算法有哪些呀?五百多页的AmberTools英文参考手册看着很苦恼。
发表于 2016-3-23 08:52:37 | 显示全部楼层
就看ptraj那一章就好
 楼主| 发表于 2016-3-24 13:12:47 | 显示全部楼层
laoman 发表于 2016-3-23 08:52
就看ptraj那一章就好

谢谢啦已经在看
 楼主| 发表于 2016-5-16 12:48:57 | 显示全部楼层
laoman 发表于 2016-3-23 08:52
就看ptraj那一章就好

用cpptraj对轨迹文件进行聚类,那些指令不是很懂,能否说明一下呢
发表于 2016-5-17 19:54:04 | 显示全部楼层
lily_fj 发表于 2016-5-16 12:48
用cpptraj对轨迹文件进行聚类,那些指令不是很懂,能否说明一下呢

我也不懂,没有用到,如果我要用了再自己看manual来做。还有一个地方可以找到相应的case,就是amber 12的mailing list。
发表于 2016-5-17 19:54:11 | 显示全部楼层
lily_fj 发表于 2016-5-16 12:48
用cpptraj对轨迹文件进行聚类,那些指令不是很懂,能否说明一下呢

我也不懂,没有用到过,如果我要用了再自己看manual来做。还有一个地方可以找到相应的case,就是amber 12的mailing list。
 楼主| 发表于 2016-5-18 21:04:29 | 显示全部楼层
laoman 发表于 2016-5-17 19:54
我也不懂,没有用到过,如果我要用了再自己看manual来做。还有一个地方可以找到相应的case,就是amber 12 ...

恩恩谢谢自己再学学
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