生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 4834|回复: 6

[AMBER] Amber自带的聚类算法

[复制链接]
发表于 2016-3-22 19:18:10 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
本帖最后由 lily_fj 于 2016-3-22 19:21 编辑

新人要准备使用Amber,Amber自带的聚类算法有哪些呀?五百多页的AmberTools英文参考手册看着很苦恼。
发表于 2016-3-23 08:52:37 | 显示全部楼层
就看ptraj那一章就好
 楼主| 发表于 2016-3-24 13:12:47 | 显示全部楼层
laoman 发表于 2016-3-23 08:52
就看ptraj那一章就好

谢谢啦已经在看
 楼主| 发表于 2016-5-16 12:48:57 | 显示全部楼层
laoman 发表于 2016-3-23 08:52
就看ptraj那一章就好

用cpptraj对轨迹文件进行聚类,那些指令不是很懂,能否说明一下呢
发表于 2016-5-17 19:54:04 | 显示全部楼层
lily_fj 发表于 2016-5-16 12:48
用cpptraj对轨迹文件进行聚类,那些指令不是很懂,能否说明一下呢

我也不懂,没有用到,如果我要用了再自己看manual来做。还有一个地方可以找到相应的case,就是amber 12的mailing list。
发表于 2016-5-17 19:54:11 | 显示全部楼层
lily_fj 发表于 2016-5-16 12:48
用cpptraj对轨迹文件进行聚类,那些指令不是很懂,能否说明一下呢

我也不懂,没有用到过,如果我要用了再自己看manual来做。还有一个地方可以找到相应的case,就是amber 12的mailing list。
 楼主| 发表于 2016-5-18 21:04:29 | 显示全部楼层
laoman 发表于 2016-5-17 19:54
我也不懂,没有用到过,如果我要用了再自己看manual来做。还有一个地方可以找到相应的case,就是amber 12 ...

恩恩谢谢自己再学学
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-3-29 23:36 , Processed in 0.118438 second(s), 19 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表