DS 药物的虚拟筛选

SYPHU_me · 发表于 2012-11-26 17:59:15

南华-ET 发表于 2012-11-26 17:05

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文献中没有提是否加氢，是我师兄和老板说的要去氢和考虑电荷的影响，我在文献中也看到确实没有氢。
...

恩，好的，谢谢你的分享

粉猪是我 · 发表于 2013-2-27 09:59:18

我最近在用HipHop的时候经常报错，在此想讨教一下，训练集分子准备的话，具体需要注意哪些呢？我看教程上都是拿的直接的训练集分子，没有具体说明~~~

南华-ET · 发表于 2013-3-9 21:52:31

粉猪是我发表于 2013-2-27 09:59

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我最近在用HipHop的时候经常报错，在此想讨教一下，训练集分子准备的话，具体需要注意哪些呢？我看教程上都 ...

用HipHop做药效团时要考虑训练集分子的活性，一般小分子的活性要跨越4个数量级以上（0.1-1000nm），然后分子结构要有多样性。结构相似的小分子的活性尽量不要再同一个数量级上。

化合物结构兼具多样性
活性跨度至少达到4个数量级
活性相似的化合物结构不同
每个数量级水平分子至少3个
结构类似化合物活性相差至少一个数量级

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