生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 4339|回复: 0

[AMBER] amber fold protein 在heating阶段出现的问题

[复制链接]
发表于 2015-11-12 15:52:29 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
我用amber  fold my protein 在分步heating时出现了‘突刺 ’ 几乎每次都是升温的第一步这是什么显现,我的参数合理吗?
Stage 1 heating of complex 0 to 50K
&cntrl
  imin=0, irest=0, ntx=1,
  nstlim=10000, dt=0.0005,
  ntc=2, ntf=2,
  ntt=3,  gamma_ln = 2.0,
  tempi=0.0, temp0=50.0,
  ntpr=50, ntwx=50,
  ntb=0, igb=8, ioutfm=1,  iwrap=0,nscm=1,   ntwr=500,
  cut=999.,rgbmax=999.
/
END


几乎升温的第一步都出现了突刺

几乎升温的第一步都出现了突刺
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-12-26 01:32 , Processed in 0.053770 second(s), 24 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表