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[AMBER] update_amber脚本

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发表于 2015-8-10 20:36:54 | 显示全部楼层 |阅读模式

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最近在安装amber,想用update_amber来更新,不过抓狂的事情就是每次运行这个脚本时要么就是socket.timeout: timed out要么就是 NoInternetAccess: Cannot connect to http://ambermd.org。基本无法更新,这个是正常么?大家有没有遇到过这个情况?
能不能好好的升级一下amber啊。


 楼主| 发表于 2015-8-11 22:35:10 | 显示全部楼层
本帖最后由 lrf1980 于 2015-8-12 07:16 编辑

仔细研究手册发现居然还有一个本地更新的办法
可以将amber14 和ambertools14的更新文件通过其他的方式下载到本地机器的某个目录里。然后通过改变更新方式实现amber的更新
./update_amber --amber-updates=/home/username/path/amber/updates
./update_amber --ambertools-updates=/home/username/path/ambertools/updates

我这里就是分别把amber更新文件放在了/home/username/path/amber/updates 目录里, ambertools的更新文件放在了/home/username/path/ambertools/updates

然后正常的运行./configure gnu, 就可以直接从本地机器update amber了

点评

兄这个办法好,解决了集群不能连外网的问题。  发表于 2015-8-14 13:54
 楼主| 发表于 2015-8-11 22:56:08 | 显示全部楼层
附件是amber14升级包

path.tar.gz

1.75 MB, 下载次数: 12

发表于 2015-10-4 23:40:07 | 显示全部楼层
兄弟,你的包是在哪下的
 楼主| 发表于 2015-10-8 21:36:32 | 显示全部楼层
husong 发表于 2015-10-4 23:40
兄弟,你的包是在哪下的

amber官网下载的
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