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[Gromacs] 关于g_energy

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发表于 2015-3-26 16:50:35 | 显示全部楼层 |阅读模式

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对MD结果分析,g_energy -f md.edr -s md.tpr -o Potential.xvg -b 15001 -e 40000,然后选择Potential,在终端界面立刻输出结果为
Energy                      Average         Err.Est.       RMSD       Tot-Drift
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Potential                -2.5766e+06         27          1626.5      -103.772  (kJ/mol)

我想问一下,Average、Err.Est、RMSD、Tot-Drift分别是什么意思?尤其是Tot-Drift代表什么意思,好像都是用这个值来作图的,但为什么输出的-o Potential.xvg中只有一列Average的值,根本就没有Tot-Drift的任何信息?
发表于 2015-3-28 13:46:06 | 显示全部楼层
建议楼主看手册,上面写的很清楚。
发表于 2015-3-30 19:52:35 | 显示全部楼层
同问,手册你指的是manual吗??翻了半天没看到啊??搜Err.Est.也搜不到,Tot-Drift也没搜到。
请问,在哪一章呢?
发表于 2015-3-30 19:52:58 | 显示全部楼层
邓健 发表于 2015-3-28 13:46
建议楼主看手册,上面写的很清楚。

同问,手册你指的是manual吗??翻了半天没看到啊??搜Err.Est.也搜不到,Tot-Drift也没搜到。
请问,在哪一章呢?
发表于 2015-3-31 14:42:18 | 显示全部楼层
zhangmao511 发表于 2015-3-30 19:52
同问,手册你指的是manual吗??翻了半天没看到啊??搜Err.Est.也搜不到,Tot-Drift也没搜到。
请问,在 ...

manual g_energy
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