在Gromacs里压力耦合参数里有一个参数refcoord-scaling，想问一下将refcoord-scaling参数设置成com和all，模拟结果有什么区别吗？
我的体系是一个膜蛋白的体系，以这个体系为例,这2个参数设置不同的实质区别在哪呢？
Note：我已经看过GMX手册上关于refcoord-scaling的解释，还是有点不太懂，难道差别只是“The vectors of each reference coordinate to the center of mass are not scaled”吗？？ 在这里请教了，谢谢各位大侠的指点，希望能得到一些经验解释，感谢!!
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发表于 2015-2-8 21:24:12
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