搭建蛋白质结构

dongdawn

只知道蛋白质的序列，pdb中没有其结构，只想搭建一个无序的蛋白出来，怎样才能搭建？
听说可以用TraDES random coil generator,但是找了很久也没有找到，求大神指导。

川大-灰太狼

你要搭建蛋白的三维结构，通常有两种方法：1、同源模建的方法，此方法需要有较高一致性的模板（已知蛋白的三维结构），此方法精度是目前最好的；2、如果没有好的模板，则需要从头模建，但此方法不可靠，可以有穿针引线法，还有直接MD预测（仅限20个左右氨基酸序列的小蛋白）。