dssp画二级结构变化图

dongdawn · 发表于 2014-12-11 16:57:51

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用do_dssp生成xpm格式数据，将其转化为eps图片，（xpm2ps -f dssp.xpm -o dssp.eps），图片质量太差了怎么办。还有些字母也显示不出来。

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一泓山人 · 发表于 2014-12-11 19:31:03

在gromacs安装目录/public/home/software/gromacs5/share/gromacs/top里面有个ps.m2p，里面二级结构的颜色代码，横纵坐标都可以设置

陈大亚 · 发表于 2014-12-24 17:17:06

我的gromacs是4.6.6版，然后不知道装什么版的DSSP，装dsspcmbi.zip说是版本不对,因为看到是支持dssp2.1及以后的版本，现在在网下的dssp-2.1.0.tgz不知道怎么安装，求助！

dongdawn · 发表于 2014-12-29 10:46:53

陈大亚发表于 2014-12-24 17:17
我的gromacs是4.6.6版，然后不知道装什么版的DSSP，装dsspcmbi.zip说是版本不对,因为看到是支持dssp2.1及以 ...

网上有直接编译好的，谷歌就行，下载dssp-2.0.4-linux-amd64，后来chomd，最后把路径加到你的.bashrc就行了

陈大亚 · 发表于 2014-12-30 21:34:46

dongdawn 发表于 2014-12-29 10:46
网上有直接编译好的，谷歌就行，下载dssp-2.0.4-linux-amd64，后来chomd，最后把路径加到你的.bashrc就行 ...

解决了，谢谢！

有你就足够 · 发表于 2016-8-6 19:54:25

楼主，你的问题解决了没？最近小弟也遇到这样的问题

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[Gromacs] dssp画二级结构变化图