使用pymol如何选择氨基酸残基，可以单独设置球棍模型的半径

yuyanqing · 发表于 2014-12-3 17:12:42

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各位，我想用球棍模型来显示氨基酸残基，同时改变它们的半径，我使用的命令是：set stick_radius,0.3 可是这个命令是把所有的氨基酸残基的半径都设为0.3，而我只是想把其中的几个的半径设为0.3，那么命令是什么呢？请各位指导下。通俗点讲，就是我想把23，24位的氨基酸残基的球棍模型的半径设为0.3，而不是把所有的都设为0.3，该怎么输入命令？多谢各位哈

laoman · 发表于 2014-12-5 09:04:05

哥们，这个在pymol好像好难办到，建议你用球棍模型显示想突出显示的residues，其他的不显示或显示为lines。

sunnyboyluan · 发表于 2014-12-5 11:39:59

可不可以这样：display>sequence, 在sequence中点击你所要标记的氨基酸残基，然后sele>S>stick, 最后再用命令行修改半径

天理-小新 · 发表于 2014-12-5 18:25:44

set_bond stick_radius, ''size'', selection

lrf1980 · 发表于 2014-12-21 18:16:42

1. select resi 23+24
2. show sticks, sele
3. set stick_radius, 0.3

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