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[其他] 【致谢飞天大神及各位坛友】ubuntu、gromacs、g_mmpbsa的安装

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发表于 2014-11-27 22:00:32 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 light 于 2014-12-2 13:14 编辑

ubuntu安装:
http://www.ubuntu.com/download/
免费得Linux系统。下载的时候选折alternative download用种子下载会下载的很快
http://jingyan.baidu.com/article/ff42efa9423991c19e22020d.html
系统安装教程。做个启动盘,全程无脑安装,最好在联网情况下进行。
系统的安装不会出什么问题,全程应该都很顺利。

gromacs的安装:
在ubuntu下,连接互联网。
sudo apt-get install gcc
sudo apt-get install g++
sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install cmake
sudo apt-get install gromacs
过程中提示你缺什么就装什么,全程无脑安装。
自动安装出来的是4.6.5的版本,单精度并行版。

g_mmpbsa的安装:
现在根本不用编译了
http://rashmikumari.github.io/g_ ... d-Installation.html
按照说明下载相应地版本,直接复制粘贴就好了。再也不用担心装不上的问题。
无脑安装。


谨以此贴感谢飞天大神和群里的朋友们给予我的无私帮助,并献给以后和我一样的初学者们,祝愿你们能少走弯路!
 楼主| 发表于 2014-12-7 20:20:59 | 显示全部楼层
zhangmao511 发表于 2014-12-6 00:25
问一下,g_mmpbsa现在是不是只支持gromacs4.6.X的版本啊??5.0以上的版本不支持吗?? ...

http://rashmikumari.github.io/g_mmpbsa/
Supports GROMACS 4.5.x and 4.6.x versions.
官网上是这样写得。
至于5.0能不能用我也不知道啊,你可以装了试试,也不麻烦。
 楼主| 发表于 2015-9-24 21:47:05 | 显示全部楼层
kangsgo 发表于 2015-8-3 13:34
请问一下这样装下来默认是装在哪里了呀?

额,我也不知道装哪了,不过能用就可以了啊
发表于 2018-3-30 09:28:58 | 显示全部楼层
kangsgo 发表于 2015-8-3 13:34
请问一下这样装下来默认是装在哪里了呀?

which mdrun
发表于 2014-12-1 09:17:16 | 显示全部楼层
给力啊,期待MMPBSA分析经验帖
 楼主| 发表于 2014-12-1 12:14:58 | 显示全部楼层
atmdd 发表于 2014-12-1 09:17
给力啊,期待MMPBSA分析经验帖

做完了一定会发的
发表于 2014-12-6 00:25:27 | 显示全部楼层
问一下,g_mmpbsa现在是不是只支持gromacs4.6.X的版本啊??5.0以上的版本不支持吗??
发表于 2014-12-6 00:25:54 | 显示全部楼层
问一下,g_mmpbsa现在是不是只支持gromacs4.6.X的版本啊??5.0以上的版本不支持吗??
发表于 2015-1-31 21:53:35 | 显示全部楼层
给力,帮了我大忙
发表于 2015-7-27 13:58:59 | 显示全部楼层
顶一下师弟
发表于 2015-8-3 13:34:38 来自手机 | 显示全部楼层
请问一下这样装下来默认是装在哪里了呀?
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