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[Gromacs] 如果使用GPU加速,那.mdp文件会有什么不同?

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发表于 2014-11-20 19:26:53 | 显示全部楼层 |阅读模式

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如题,想请教一下大家,GMX已经使用GPU加速的同学,.mdp文件是否有不同,能够提供一个模版分享下?谢谢
 楼主| 发表于 2014-11-21 10:34:33 | 显示全部楼层
在用GPU加速的时候,出现这种情况, Force evaluation time GPU/CPU :7.197ms/2.258=3.187
For optimal performance this ratio should be close to 1!应该怎么解决呢?
 楼主| 发表于 2014-11-22 15:16:55 | 显示全部楼层
除了设置cutoff-scheme= Verlet之外,官网有更详细的解释。请大家遇到同样问题之后去gmx官网查询。
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