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[AMBER] 用antechamber时打不开文件在rpdb()怎么破求解!

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发表于 2014-11-17 21:37:48 | 显示全部楼层 |阅读模式

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现在还在按照官网的tutorial做的菜鸟,遇到了一点麻烦。当我敲入 antechamber -i sustiva_new.pdb -fi pdb -o sustiva.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2后,却出现了 cannot open the input file:sustiva_new.pdb in rpdb(),exit的错误。
求解,rpdb是个啥


 楼主| 发表于 2014-11-18 21:23:56 | 显示全部楼层
viger87 发表于 2014-11-18 12:04
1.确保你的文件可读,输入:ls -l sustiva_new.pdb  (看看结果)
2.确保你的sustiva_new.pdb 文件没问题
3 ...

太感谢了!文件是nogourp,不是我用户名下的。百度了chown的用法,修改了文件权限现在可以了!好爱你啊!!!
另,再厚颜无耻地问一下下修补antechamber补丁用什么command?
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