关于用AUTODOCK做两个小分子间的对接

tjpugu

tjpugu 发表于 2014-12-1 20:28
我照着教程做的，这一步Grid →Grid Box…后确实生成了一个GPF 文件，但RUN Autogrid后log filename那一 ...

谢谢，我重输入一遍GPF已经生成了Log文件了

tjpugu

现在又遇到新问题了，Autogrid点Launch后出现了一大片代码，显示有错误，又不能继续进行了，我真是问题不断，只有请能人帮我解答了

tjpugu

Python 2.5.2 (r252:60911, Feb 21 2008, 13:11:45) [MSC v.1310 32 bit (Intel)] on win32
Type "copyright", "credits" or "license()" for more information.

    ****************************************************************
    Personal firewall software may warn about the connection IDLE
    makes to its subprocess using this computer's internal loopback
    interface.  This connection is not visible on any external
    interface and no data is sent to or received from the Internet.
    ****************************************************************
   
IDLE 1.2.2      ==== No Subprocess ====
>>> ERROR *********************************************
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto
    result = command( *args, **kw )
  File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autostartCommands.py", line 964, in doit
    ps = subprocess.Popen(args)
  File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.6\lib\subprocess.py", line 594, in __init__
    errread, errwrite)
  File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.6\lib\subprocess.py", line 816, in _execute_child
    startupinfo)
WindowsError: [Error 2]

tjpugu

不知道是否有人知道这是什么意思

dongjun1120

请问一下，您现在能用了么？我是新手，想请您指点一下，不知可以么？

tjpugu

dongjun1120 发表于 2015-3-21 21:07
请问一下，您现在能用了么？我是新手，想请您指点一下，不知可以么？

当然可以，但我知道的也有限

tjpugu

tjpugu 发表于 2015-4-1 10:50
当然可以，但我知道的也有限

你现在有什么问题吗

Jzliu

tjpugu 发表于 2014-12-1 19:02
请问两个小分子对接，配体和受体是不是都可以自己用chemoffice画，画好都要做MM优化吗 ...

画……你是多么 有毅力~

sangdy8

tjpugu 发表于 2014-12-1 22:13
Python 2.5.2 (r252:60911, Feb 21 2008, 13:11:45) [MSC v.1310 32 bit (Intel)] on win32
Type "copyrigh ...

您好。这个故障，最后是怎么解决的呢？新手求帮助。