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[Rosetta] 关于Rosetta信息与资源

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发表于 2014-9-6 10:33:38 | 显示全部楼层 |阅读模式

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Rosetta是高级生物计算模拟程序,其不同的程序模块可以实现不用的模拟计算主要有蛋白结构从头预测,同源建模、loop区补全蛋白(活性小肽)、酶的设计、蛋白-蛋白对接、配体小分子对接(可实现双配体同时对接),蛋白结构预测(抗体 Fv区结构预测)等许多功能,具体的可以参考连接https://www.rosettacommons.org/support/overview。rosetta 给我的感觉是其灵活性,通过rosetta我们可以很容易的去操控分子的模拟。在此提供一个下载rosetta的链接 https://www.rosettacommons.org/software/academic/
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rosetta可以实现平行计算,并且学习资料很多,官网有视频和pdf操作案例,软件安装后相应的演示文件。一般发表的文献都会有详细的方法、命令和配置文件。欢迎对rosetta有深入研究的前辈在此留下宝贵的资源和经验,欢迎各位多多发帖交流,谢谢!
 楼主| 发表于 2015-2-3 14:37:32 | 显示全部楼层
本帖最后由 天理-小新 于 2015-2-3 15:04 编辑
木头珊瑚 发表于 2015-2-3 08:28
下载了,没有setup,我就懵了,是不用安装么?求楼主给一份中文教程

官网有二进制版本的和原代码版本的。二进制版5G左右,代码1.7左右。二进制版本不用安装就可以用,但不支持并行。若要并行还得自己编译。至于中文教程没有,还是直接看官网的教程吧,很详细了。还有安装程序后demo文件中有案例。
发表于 2014-9-7 00:09:44 | 显示全部楼层
原来所有的academic user的账号和密码都一样的。。。
发表于 2014-10-30 22:19:44 | 显示全部楼层
ROSETTA才开始接触
发表于 2014-12-15 10:31:50 | 显示全部楼层
有做rosetta从头建模的么?
发表于 2014-12-15 20:59:24 | 显示全部楼层
呵呵 好东西哈!支持,功能强大。
发表于 2015-2-3 08:28:53 | 显示全部楼层
下载了,没有setup,我就懵了,是不用安装么?求楼主给一份中文教程
 楼主| 发表于 2015-2-3 14:33:23 | 显示全部楼层
xxffliu 发表于 2014-9-7 00:09
原来所有的academic user的账号和密码都一样的。。。

基本都不变,一个账号可用于下载多个版本
 楼主| 发表于 2015-2-3 14:34:50 | 显示全部楼层
tonett 发表于 2014-12-15 10:31
有做rosetta从头建模的么?

rosetta从头建模是其功能之一。但氨基酸序列不过多。一般200左右,可靠性较高。
发表于 2015-2-20 03:59:42 | 显示全部楼层
天理-小新 发表于 2015-2-3 14:37
官网有二进制版本的和原代码版本的。二进制版5G左右,代码1.7左右。二进制版本不用安装就可以用,但不支持 ...

谢谢楼主
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