模拟突变后的蛋白质优化问题

N.S. · 发表于 2013-8-6 21:46:00

我用的薛定谔，直接选中某残基，右击改成你要的残基就ok了

你好，格格，感觉直接将残基突变这个方法比较简单，那突变完之后是需要重新生成prmtop文件，再计算结合能吗？

爱笑的格格 · 发表于 2013-12-4 15:54:49

你好，格格，感觉直接将残基突变这个方法比较简单，那突变完之后是需要重新生成prmtop文件，再计算结合能 ...

薛定谔计算能量是不要生成这个坐标文件的。

徐小陌 · 发表于 2013-12-4 16:12:37

催化三联体？不会也是alpha/beta水解酶家族的吧~哈哈~结合自由能对于解释对映体选择性还是很有帮助的，你 ...

这个氢键角度怎么测？

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