Amber做能量最小化时输出文件的问题

北京2013 · 发表于 2014-7-8 09:09:24

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记得以前看到过，用Amber做能量最小化时，首先进行最陡下降法进行计算，然后对体系进行共轭梯度的计算，直到min.out文件中的GMAX项达到E-01才可以进行下面的加热过程。但是我不断的增加了最陡下降法和共轭梯度法 的次数，发现自己的体系就是达不到上述要求。所以想请教各位前辈：GMAX的具体含义是什么？为什么它需要满足E-01的要求呢？需要改变那些参数才能满足上述要求？或者各位有没有学习输出文件的相关资料呢？
问题有点多，先谢谢大家的耐心，同时也期待大家的解答！

北京2013 · 发表于 2014-7-10 08:49:10

为什么没人回复呢？

自己顶一下，期待高手解疑

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[AMBER] Amber做能量最小化时输出文件的问题

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