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[Pymol] 使用Pymol导出3d图形到pdf中

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发表于 2012-12-10 10:29:15 | 显示全部楼层
在win下,通过你提供的第一种解决方案来执行。
遇到问题如下:
1. 在pymol中,用save命令保存后,我不知道把*.idtf文件保存到哪里了,怎么设定和找路径?(以前这个问题,我就没整明白,都是通过图形界面保存的)
2. *.u3d文件,偶也不知道保存到哪了
在win下,通过搜索也没找到

我的运行结果是这样的,和你的一样吗?有问题没?
2012-12-10_102506.png
3. 另外没用到你说的下面的相关内容(这个要在什么地方用):
3Daac=20.0, 3Droll=0, 3Dc2c=0 0 1, 3Droo=106.23, 3Dcoo=0 0 -106.23

感谢你抽空帮我看看,再次感谢!
发表于 2012-12-24 13:47:13 | 显示全部楼层
可以用VMD制作3d-pdf文件,方法非常简单,官网上有教程。
 楼主| 发表于 2012-12-28 21:03:09 | 显示全部楼层

不好意思,最近比较忙……这个问题你只需要在文件名前面加上路径即可,按你的截图来看,文件应该是生成在了C盘的根目录了,就是直接打开C盘就可以看到了。
 楼主| 发表于 2012-12-28 21:04:31 | 显示全部楼层
tobeant 发表于 2012-12-24 13:47
可以用VMD制作3d-pdf文件,方法非常简单,官网上有教程。

VMD是有acrobat3d的接口的,不过貌似目前只有在安装了acrobat professional extended之后才能使用。
发表于 2012-12-28 21:41:11 | 显示全部楼层
发表于 2013-8-23 12:22:16 | 显示全部楼层
牛!感谢分享!
发表于 2013-9-5 09:13:49 | 显示全部楼层
,厉害呀
发表于 2014-1-15 11:17:30 | 显示全部楼层
好厉害,膜拜
发表于 2014-1-15 11:18:31 | 显示全部楼层
转一个,学习之
发表于 2014-7-20 10:52:57 | 显示全部楼层
SYPHU_me 发表于 2012-12-10 10:29
在win下,通过你提供的第一种解决方案来执行。
遇到问题如下:
1. 在pymol中,用save命令保存后,我不知道 ...

无聊尝试重复了一遍,save完后,*.idtf在C:\Python27\Pymol下,然后把*.idtf拷到C:\users\主文件夹下(即命令提示符前的路径),再运行,可以从上述文件夹找到*.u3d。

                               
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