使用Pymol导出3d图形到pdf中

SYPHU_me · 发表于 2012-12-10 10:29:15

在win下，通过你提供的第一种解决方案来执行。
遇到问题如下：
1. 在pymol中，用save命令保存后，我不知道把*.idtf文件保存到哪里了，怎么设定和找路径？（以前这个问题，我就没整明白，都是通过图形界面保存的）
2. *.u3d文件，偶也不知道保存到哪了
在win下，通过搜索也没找到

我的运行结果是这样的，和你的一样吗？有问题没？

3. 另外没用到你说的下面的相关内容（这个要在什么地方用）：
3Daac=20.0, 3Droll=0, 3Dc2c=0 0 1, 3Droo=106.23, 3Dcoo=0 0 -106.23

感谢你抽空帮我看看，再次感谢！

tobeant · 发表于 2012-12-24 13:47:13

可以用VMD制作3d-pdf文件，方法非常简单，官网上有教程。

中大-活性小肽 · 发表于 2012-12-28 21:03:09

SYPHU_me 发表于 2012-12-10 10:29

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在win下，通过你提供的第一种解决方案来执行。
遇到问题如下：
1. 在pymol中，用save命令保存后，我不知道 ...

不好意思，最近比较忙……这个问题你只需要在文件名前面加上路径即可，按你的截图来看，文件应该是生成在了C盘的根目录了，就是直接打开C盘就可以看到了。

中大-活性小肽 · 发表于 2012-12-28 21:04:31

tobeant 发表于 2012-12-24 13:47

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可以用VMD制作3d-pdf文件，方法非常简单，官网上有教程。

VMD是有acrobat3d的接口的，不过貌似目前只有在安装了acrobat professional extended之后才能使用。

zacr1023 · 发表于 2012-12-28 21:41:11

hydrolase · 发表于 2013-8-23 12:22:16

牛！感谢分享！

黄露义 · 发表于 2013-9-5 09:13:49

,厉害呀

qiuqiushine · 发表于 2014-1-15 11:17:30

好厉害，膜拜

qiuqiushine · 发表于 2014-1-15 11:18:31

转一个，学习之

uso128497 · 发表于 2014-7-20 10:52:57

SYPHU_me 发表于 2012-12-10 10:29

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在win下，通过你提供的第一种解决方案来执行。
遇到问题如下：
1. 在pymol中，用save命令保存后，我不知道 ...

无聊尝试重复了一遍，save完后，*.idtf在C：\Python27\Pymol下，然后把*.idtf拷到C：\users\主文件夹下（即命令提示符前的路径），再运行，可以从上述文件夹找到*.u3d。

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