如何实现蛋白质定点突变（计算机模拟）

puzhongji · 发表于 2014-6-21 21:51:42

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如何实现蛋白质定点突变（计算机模拟）？

大工-阿里巴巴 · 发表于 2014-6-22 20:45:02

单纯的突变从技术层面实现很简单，难的是如何利用计算机模拟的办法去寻找针对特定特性的突变位点。前者利用foldX或者pymol就可以做，后者其实是一些专门的酶设计软件或者分子动力学模拟软件的工作。

fanc232 · 发表于 2014-6-26 19:11:28

楼上说得对。如何预测关键氨基酸残基并指导生物实验进行定点突变尝试是难点。
下面介绍一下如何做单纯的突变。
方法一：文本编辑修改序列文件，在相应位点改变氨基酸残基，然后交给同源建模软件处理。后续再进行能量最小化和结构合理性检测之类；
方法二：这个方法有点流氓，可是这也得怪国外的软件太贵而出售方法太霸道了。下载盗版的Schrodinger或者SYBYL等结构编辑软件，在视图界面选中要突变的氨基酸残基，突变成你想要的氨基酸残基，然后进行能量最小化和结构合理性检测。
如果还有更好的方法，请大家不吝赐教，我也很想学！

kkshaxqd · 发表于 2014-7-21 14:32:50

SPDviewer.

胡馨元屁屁 · 发表于 2015-3-27 16:39:48

我现在要做耐药突变对底物作用要好好学习

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