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生物分子模拟论坛»论坛 › -≡ 生物分子模拟软件区 ≡- › 【分子动力学软件】 › sybyl 质子化 protocol
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查看: 2788|回复: 2

[其他] sybyl 质子化 protocol

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发表于 2014-5-13 15:19:34 | 显示全部楼层 |阅读模式

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http://books.google.com.hk/books?id=kHmBzZYwRfsC&pg=PA69&lpg=PA69&dq=sybyl+++ligand+protonation&source=bl&ots=ugxtovFtr7&sig=VkQI6WZX9X-zMwvjw0WAvZSkSAQ&hl=zh-CN&sa=X&ei=wMJxU7SDHtTg8AW2yoH4AQ&ved=0CD8Q6AEwAzgK#v=onepage&q=sybyl%20%20%20ligand%20protonation&f=false对蛋白以及配体进行质子化处理的protocol，希望对大家有用
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发表于 2014-5-14 09:22:41 | 显示全部楼层
质子化的PH值一般设定为多少
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 楼主| 发表于 2014-5-16 15:51:27 | 显示全部楼层
这个应该考虑你体系的PH值，以及氨基酸的PKa值吧
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