NAMD轨迹dcd格式转成mdcd格式

niuyuzhen110 · 发表于 2014-3-5 10:55:17

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如题，我的复合物是用的amber力场的参数，在NAMD跑完之后还得需要在amber中分析结果，试了catdcd之后没有转成功，所以想问问大家是怎么转的？不胜感谢！

墨竹晓风 · 发表于 2014-3-5 22:04:10

试试MDAnalysis
http://bioms.org/thread-1013-1-1.html
另外，你发错区了。。。

niuyuzhen110 · 发表于 2014-3-6 21:56:52

墨竹晓风发表于 2014-3-5 22:04

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试试MDAnalysis
http://bioms.org/thread-1013-1-1.html
另外，你发错区了。。。

不好意思，以后注意，谢谢你

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[NAMD] NAMD轨迹dcd格式转成mdcd格式