生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 4246|回复: 2

[AMBER] Amber动力学结果分析

[复制链接]
发表于 2014-1-7 13:36:17 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
大家好!我用Amber模拟了一个蛋白的构象变化,这个蛋白包含两个亚基,在模拟过程中发现这两个亚基发生了刚性的相对旋转,即twisting,请问大家:我如何能表征出这样的相对旋转??我看文献可以用角度,但是我不知道什么样的角度适合。还有,在amber里面可以定义蛋白每个亚基的主成分轴吗??如果可以,用两个亚基主成分轴的夹角也可以进行表征。感谢大家的耐心解答!
发表于 2014-1-7 20:28:45 | 显示全部楼层
用二面角多一些
 楼主| 发表于 2014-1-8 10:43:00 | 显示全部楼层
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-3-28 19:41 , Processed in 0.056070 second(s), 19 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表