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楼主: double

[AMBER] 请教各位大虾分子模拟平衡过程中遇到的一个问题

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 楼主| 发表于 2013-11-25 11:25:23 | 显示全部楼层
谢谢各位大侠的帮助,问题已经解决了,是参数中二面角的问题。我把二面角全部都确认了一边,把没有的补上,就可以了。原先没改的时候,跑程序是自动选择了错误的二面角,所以才导致了键角的畸形。
发表于 2014-12-1 09:38:03 | 显示全部楼层
double 发表于 2013-11-25 11:25
谢谢各位大侠的帮助,问题已经解决了,是参数中二面角的问题。我把二面角全部都确认了一边,把没有的补上, ...

你好,我也遇到了这个问题,但是我没看明白你的解决方法,在那修改二面角,pdb文件里吗?
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