对接图像是否需要旋转

浙医-中药筛选 · 发表于 2012-10-25 14:55:14

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各位大大，请见图一和图二。图一是对接后图像，但是ligand所在的位置看不清楚，有些部位被挡住了。现在的问题是（1）发文章的时候，是否需要将对接后的复合体旋转，将ligand结合处突出出来，如图2所做。这种做法可取吗？还是不允许的？（2）如果整体图像不能旋转，空间结构不能变化，如果将对接处框出来，然后放大，这部位是否可以旋转啊？呵呵，通常这种作图注意有哪些啊？网上搜的都比较泛泛，所以想请具体分析。

浙医-中药筛选 · 发表于 2012-10-25 15:26:03

刚看到中大-活性小肽的DSV教程，很有帮助。结合位点图放大图要按照小肽介绍的方法做了。

川大-灰太狼 · 发表于 2012-10-25 15:28:32

(1) 如果你要表示蛋白的整体，并且让读者看到配体分子作用于蛋白的什么地方，整体作图是可以的。
(2) 如果采用整体图+局部放大，是比较好的效果，局部放大是可以旋转蛋白的，局部图主要是展示配体分子和氨基酸残基的作用。
总的来说，作图是根据你要表达的意思定的！

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